第十三條林業行政主管部門應當在發現或者接受舉報后進行審查，對符合本辦法第十二條規定的，在七日內予以立案，同時指定兩名或者兩名以上案件承辦人負責調查和處理。

　　第十四條案件承辦人在現場取證時，可以根據請求人或者舉報人提供的涉案品種所在地點和生長狀況等信息，及時取證并鑒定。

　　第十五條案件承辦人可以采取抽樣方法取證；在證據可能滅失或者以后難以取得的情況下，經行政機關負責人批準，可以先行登記保存，填寫《林業行政處罰登記保存通知單》，并在七日內做出處理決定；在此期間，當事人或者有關人員不得銷毀或者轉移證據。

　　第十六條對于案件涉及的植物品種，可以采用田間觀察檢測、基因指紋圖譜檢測等方法進行鑒定。

　　第十七條林業行政主管部門查處本辦法第三條第一項、第二項案件，依法做出較大數額罰款的，應當告知當事人有要求舉行聽證的權利。當事人要求聽證的，林業行政主管部門應當按照《林業行政處罰聽證規則》相關規定組織聽證。

　　第十八條縣級以上人民政府林業行政主管部門查處本辦法第三條第一項案件時，為維護社會公共利益，可以采取下列措施：

　　（一）責令侵權人立即停止對侵權品種繁殖材料的銷售行為，并且不得銷售尚未售出的采用侵權品種生產的繁殖材料；

　　（二）責令侵權人立即停止對侵權品種的生產行為，對涉及侵權的植物材料消滅活性使其不能再被用作繁殖材料；

　　（三）對正處于生長期或者銷毀侵權植物材料將導致重大不利后果的，可以沒收植物品種繁殖材料；

　　（四）沒收違法所得；

　　（五）涉案貨值金額一萬元以下的，處以一萬元罰款；一萬元至三萬元以下的，處以二萬元至九萬元罰款；三萬元至四萬元以下的，處以十萬元至十六萬元罰款；四萬元至五萬元以下的，處以十七萬元至二十五萬元以下罰款。

　　涉案貨值金額五萬元以上的，侵權行為是第一次發生且侵權數量較小的，處以涉案貨值金額五至七倍罰款；侵權人明知或者已被告知侵權、數次侵權或者侵權數量較大的，處以涉案貨值金額八至九倍罰款；侵權人數次侵權且侵權數量巨大或者為逃避處罰提供偽證的，處以涉案貨值金額十倍罰款。