目前，我國自然保護區(qū)生物多樣性的保護和恢復(fù)還面臨物種名錄更新緩慢、現(xiàn)行的生態(tài)補償政策對生物多樣性注重不夠、重視陸地，輕視水體等一些需要解決的問題。

　　資料顯示，國際上已界定的我國受威脅物種數(shù)量有792個，而國家重點保護野生動植物名錄中僅有262個與之重疊。

　　建議定期更新《名錄》，建立實時更新機制，及時提升急需保護的物種保護級別；在自然保護區(qū)政策制定和考評中，把生物多樣性作為重點指標(biāo)之一，以真正實施保護區(qū)的功能；加大對我國淡水生態(tài)系統(tǒng)研究投入，并采取有效措施監(jiān)測，保護和恢復(fù)水體生物多樣性。